Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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