Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csrnp3P59055 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csrnp3P59055 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms