Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl3P58873 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms