Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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