Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Irf5P56477 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Irf5P56477 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Irf5P56477 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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