Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp1P56183 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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