Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcanP55066 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcanP55066 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcanP55066 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcanP55066 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcanP55066 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms