Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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