Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl5P50228 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms