Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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