Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CitP49025 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CitP49025 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CitP49025 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CitP49025 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms