Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt1P46096 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syt1P46096 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt1P46096 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms