Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms