Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms