Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf1P39428 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf1P39428 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf1P39428 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf1P39428 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf1P39428 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf1P39428 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf1P39428 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms