Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms