Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rom1P32958 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms