Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RxrgP28705 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RxrgP28705 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RxrgP28705 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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