Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Hoxd10P28359 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Hoxd10P28359 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Hoxd10P28359 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Hoxd10P28359 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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