Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde6aP27664 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde6aP27664 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde6aP27664 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde6aP27664 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms