Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou2f1P25425 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms