Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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