Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms