Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms