Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cd1d1P11609 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd1d1P11609 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms