Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P10404 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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