Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms