Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtaP09225 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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