Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01787 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01787 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01787 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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