Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ptpn20O55082 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Ptpn20O55082 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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