Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms