Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Sp100O35892 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Sp100O35892 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Sp100O35892 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Sp100O35892 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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