Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms