Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm4340L7N2C4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm4340L7N2C4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4340L7N2C4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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