Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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