Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim18J3QNP2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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