Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp72F8VQC1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms