Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms