Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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