Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms