Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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