Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms