Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms