Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms