Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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H2-M5A7VMS3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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H2-M5A7VMS3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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H2-M5A7VMS3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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