Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms