Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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