Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms