Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vamp5Q9Z2P8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms