Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms